关于物种起源
19世纪50年代，英国变得更加安静和繁荣，到20世纪50年代中期，专业人士开始接管，实行考试，并建立了私立学校精英．变化的社会作文以思想自由的生物学家的崛起为代表的科学托马斯·亨利·赫胥黎-承诺更好的接待达尔文．哲学家赫胥黎赫伯特·斯宾塞而其他外地人则选择了一家世俗的理性主义者的自然威斯敏斯特审查并嘲笑“牧师身份”的影响。达尔文自己也失去了对基督教的最后一丝信仰，因为他的大女儿安妮不幸去世伤寒在1851年。
对达尔文和他的理论来说，世界变得更加安全:维多利亚中期英格兰比“饥饿的三十年代”或动荡的十九世纪四十年代更加稳定。1854年，他解决了他的最后一个主要问题，即属的分叉产生新的进化分支。他用了一种工业类比我们熟悉的Wedgwood工厂，劳动分工:竞争自然美国过度拥挤的市场将青睐能够利用a的不同方面的变体利基市场．物种将有分歧当场，就像同一屋檐下的商人。1855年，达尔文在海水中试验种子，以证明它们可以在海洋中存活物种形成在岛屿．然后他继续幻想鸽子来观察这些雏鸟是否更像祖先的岩鸽，而不是它们奇怪的父母。达尔文完善了他的类比自然选择用他的话说，这是“人工选择”。他在准备修辞战略，准备提出他的理论。
1856年4月，达尔文在唐恩与赫胥黎和胡克交谈后，开始写一本三卷本的书，暂名为自然选择该法案旨在用混乱的事实粉碎反对派。达尔文现在拥有巨大的科学和社会权威，当他宣誓就任牧师时，他在教区的地位就得到了保证治安法官在1857年。在莱尔的鼓励下，达尔文继续写作，直到他的第10个也是最后一个孩子查尔斯·韦林·达尔文(生于1856年，艾玛48岁)出生，他患有发育障碍。然而在19世纪30年代，达尔文认为物种一直保持着完美的适应性，直到环境改变了，他现在相信每一个新的变化都是不完美的，而且永恒的斗争是规则。他还解释了不育工人的进化蜜蜂在1857年。那些不能被选中的，因为它们不能繁殖，所以他选择了“家族”选择(亲族选择(如今天所知):整个殖民地都受益于他们的保留。
到1858年6月18日，达尔文已经写完了25万字。那天他收到了一封来自阿尔弗雷德·拉塞尔·华莱士他是英国社会主义者和标本收藏家马来群岛他提出了一个类似的理论。达尔文担心失去优先权，接受了莱尔和胡克的解决方案:他们读联合提取达尔文和华莱士于1858年7月1日在林奈学会发表的论文。达尔文生病了，他的小儿子死于猩红热因此，他错过了自然选择理论的第一次公开展示。这是他晚年的缺勤。
达尔文匆忙开始了一篇“摘要”自然选择后来这本书变得更通俗易懂，论自然选择的物种起源，或在生存斗争中保留优势种族．患了一场可怕的恶心想吐现年50岁的达尔文曾在这片荒无人烟的土地上隐居在一个温泉浴场约克郡1859年11月22日，这本书被卖给了商人。他仍然担心最坏的情况，并将副本连同谦逊的信件寄给了专家们(“你们多么渴望把我活活钉死在十字架上”)。他说，那几个月就像“生活在地狱里”。
这本书的确使他苦恼剑桥赞助人，但他们是边缘人科学现在。然而，激进的持不同政见者和起义者都表示同情伦敦生物学家和地质学家，即使很少有人真正采用达尔文的成本效益方法自然．的报纸得出了一个达尔文刻意回避的结论:那就是人类从猿达尔文否认了这一点人类的永生．一个敏感的达尔文，不亲自露面，让赫胥黎他现在已经是我的好朋友了。的好斗的赫胥黎喜欢公开辩论，而达尔文讨厌公开辩论。他从事这项事业有他自己的理由，而且热情十足。他写了三篇评论物种起源辩护人类进化1860年，在英国科学促进会的牛津会议上，毕夏普发表了讲话塞缪尔·威尔伯福斯他开玩笑地问猿是赫胥黎的祖母还是祖父那一边的)，并发表了自己的文章书在人类进化，关于人在自然中的地位的证据(1863)。赫胥黎拥护的是达尔文的进化论自然主义他的非奇迹般的假设，将生物科学推向了先前禁忌并增加了赫胥黎专家的力量。是他们获得了英国皇家学会的科普利奖章达尔文在1864年
赫胥黎对进化论的热情和对自然选择的冷静看法是典型的。自然选择——赫歇尔轻蔑地称之为“杂乱无章定律”——在达尔文的时代几乎没有得到支持。相比之下，进化本身(达尔文称之为“下降”)——这个词进化只在1872年的最后一版起源)在1866年得到了英国协会的认可。也是在那一年，达尔文遇到了他的德国崇拜者——动物学家Ernst Haeckel,他的使改变宗教信仰会传播Darwinismus穿过普鲁士世界。两年后，国王普鲁士授予达尔文勋位Pour le Mérite．
家里实验室里的家长
19世纪60年代，长期的疾病使人衰弱，使嶙峋的、留着胡子的达尔文消瘦不堪。他曾连续呕吐27天。唐·豪斯是一间医务室，在那里生病是常态，艾玛是陪同护士。她是一块盾牌，保护着族长，宠着他。达尔文对种族和性别的刻板印象是典型的维多利亚时代的人——无论他多么依赖他那令人敬畏的妻子，他仍然认为女人低人一等;尽管狂热的虽然他是废奴主义者，但他仍然认为黑人是下等人比赛．但除了主张平等主义的社会主义者之外，很少有人对此提出质疑偏见以及达尔文，沉浸在竞争激烈的辉格党中文化并将其价值观铭记于心科学，没有时间社会主义．
这房子也是一个实验室达尔文在那里继续实验和改进起源经过六个版本。尽管他默默地以“我的神‘自然选择’起誓”，但他对批评者的回答是，再次强调了其他导致变化的原因——例如，持续使用一个器官的影响——而且他提振拉马克学派认为，这种通过过度使用而产生的改变可能会遗传下去。在动物和植物在驯化下的变化(1868)他整理了事实，并探索了家养品种变异的原因。这本书回应了诸如乔治•道格拉斯坎贝尔，第八任阿盖尔公爵，他讨厌达尔文盲目的，偶然的变异过程设想以“新生”为目标的出现。通过展示花者从自然发生的变化中挑选出他们喜欢的簇和顶结鸽子，达尔文破坏了这种天意的解释。
1867年，工程师Fleeming Jenkin认为任何单一的有利变异都会在种群内部的反向繁殖中被淹没和丢失人口．没有已知的遗传机制，所以在变异达尔文设计了假设的“泛生论来解释性状的离散遗传。他想象着有机体的每一个组织都释放出微小的“胚芽”，这些胚芽传递给性器官，并允许在下一代中复制自己。但是达尔文的表亲弗朗西斯·高尔顿没能在里面找到那些小粒兔子血，这个理论被推翻了。
达尔文善于侧翼攻击，以绕过批评他的人。他会处理一些看似棘手的问题兰花花并让它们成为“自然选择”的测试案例。因此，这本书出现在起源让所有人惊讶的是，英国和外国兰花由昆虫受精的各种发明(1862)。他展示了兰花玫瑰的美丽不是上帝为了取悦人类而“设计”出来的奇思妙想，而是经过选择的磨练来吸引人的昆虫cross-pollinators．花瓣引导蜜蜂到达蜜腺，然后花粉囊是沉积正好可以被另一种花的柱头去掉。
但是为什么异花授粉如此重要呢?达尔文的植物学研究总是与他的进化机制有着微妙的联系。他相信异花授粉的植物会比自花授粉的植物生出更健康的后代。为了证明这一点，他运用了相当大的智慧，进行了数千次杂交。研究结果发表在杂交和自花受精对植物王国的影响(1876)。他的下一本书，同一种植物上花的不同形态(1877年)，再次被长期工作的结果变成了方式进化在一些物种偏爱不同的雄性和雌性形式的花促进异族通婚。达尔文一直以来都对近亲繁殖因为他自己和他妹妹卡洛琳都娶了韦奇伍德家的表妹。他为这对他的五个儿子造成的损害而苦恼。他并不需要担心，因为他们过得很好:威廉成了银行家，伦纳德成了陆军少校，乔治剑桥大学普卢米安天文学教授弗朗西斯是其中的一位读者植物学霍勒斯是一名科学仪器制造商。达尔文也研究过食虫植物，攀缘植物，以及植物对植物的反应重力而且光（阳光他认为，这激活了茎尖的某种东西，这一想法指导了未来的生长研究激素在植物)。