巴希尔

与南方的和平努力

在此期间，与苏丹人民解放军的战争仍在继续，数百万南方人流离失所。巴希尔不时地做出这样的决定试探性的与反政府武装的边缘分子达成了停火协议，但是，当1998年南北边境地区开始大规模生产石油时，争端变得更加激烈。在国际压力下，巴希尔2005年同意与苏丹人民解放军签订和平协议。

达尔富尔冲突和国际刑事法庭指控

与此同时，2003年8月，非洲黑人反叛组织进入达尔富尔曾对巴希尔政府发起攻击，声称受到不公平待遇。为了打击达尔富尔起义，总统获得了阿拉伯民兵组织的援助贾贾威德他的残暴手段令该地区的平民感到恐惧国际援助该组织通过提供急需的食品和医疗用品，并使200多万人流离失所，收入艰难批评来自国际评论员。随着达尔富尔冲突的激烈进行，巴希尔勉强接受了一个非常小的国家的到来非洲联盟(非盟)维和部队但抵抗了非盟维和部队的企图联合国(联合国)派遣更大的国际部队。非盟维和特派团最终被联合国-非盟联合特派团所取代，该特派团于2008年开始部署。

2008年7月14日，首席检察官国际刑事法院国际刑事法院要求对巴希尔发出逮捕令。他因在达尔富尔犯下反人类罪、战争罪和种族灭绝罪而被传讯。苏丹政府不是创建国际刑事法庭条约的缔约国，否认并宣布巴希尔无罪。2009年3月4日，国际刑事法院发布了对巴希尔的逮捕令——这是国际刑事法院第一次寻求逮捕在任国家元首——指控他犯有战争罪和反人类罪，但没有以种族灭绝罪;2010年7月，国际刑事法院发布了第二次逮捕令，这次指控巴希尔种族灭绝．

巴希尔的国际刑事法院逮捕令在2014年12月再次成为头条新闻，当时国际刑事法院检察官宣布，由于国际刑事法院缺乏行动，她暂停了对巴希尔案件的调查联合国安全理事会迫使巴希尔出庭。

退役，继续统治，分裂

与此同时，巴希尔于2010年1月从武装部队指挥官的职位上退休，他自1989年政变以来一直担任这个职位。他这样做是为了遵守有关候选人资格的法律规定，以便能够接受立法会的提名全国大会党;他们将参加即将于2010年4月举行的总统选举，这将是阿富汗20多年来首次多党选举。巴希尔今年4月以大约68%的选票再次当选。然而，民意调查被他的两个主要反对派候选人在比赛前退出蒙上了阴影所谓已经有迹象表明选举存在舞弊行为，而且一些国际观察员宣布选举没有达到国际标准。

根据2005年与南部反政府武装达成的协议，2011年1月，苏丹南部公民举行了全民公投，以决定南部是继续留在苏丹还是脱离苏丹。2011年7月9日，压倒性的投票结果显示人们倾向于脱离欧盟。南部油田的损失以及与苏丹新邻国的持续冲突所带来的经济后果，南苏丹以及与苏丹境内反叛组织的斗争，主导了巴希尔的总统任期。反对派组织和公众越来越多地表达了他们对全国大议会无力改善经济状况、寻找和平解决办法来结束叛乱活动或采取行动的不满宪法改革。巴希尔政权使用了严厉的策略，试图平息公开表达的异议，并限制媒体。

随着2015年大选的临近，巴希尔再次成为全国大会党总统候选人。尽管抵制在大部分反对派的选举中，仍有十几个总统候选人。然而，巴希尔在4月13日至16日的选举中轻松赢得连任，官方结果显示，他获得了大约94%的选票。除了反对派的抵制之外，选举也受到了低投票率的影响——尽管官员们将投票时间延长了一天——以及国际社会对苏丹没有提供投票的批评有利环境为了可信的选举。

挑战他的统治

巴希尔面临着前所未有的民众骚乱，这场骚乱始于2018年12月，一直持续到次年。一开始的小规模自发抗议活动是对该国经济困境及其对苏丹人生活条件的影响感到失望，很快演变成更大规模的有组织的反政府游行和示威，许多抗议者和反对派领导人要求巴希尔下台。他拒绝了，说他只有在被选举下台后才会离开。

2019年2月，面对持续不断的抗议活动，巴希尔采取了几项行动，包括宣布进入紧急状态，解散中央政府和州政府，任命新的总统总理禁止未经授权的示威活动。然而，这并没有阻止有组织的抗议活动。3月，他辞去了全国大会党主席的职务，并承诺举行一次选举对话与反对派一起实施改革。然而，巴希尔仍然不愿下台，示威活动仍在继续。

该运动迄今为止规模最大的抗议活动发生在2019年4月6日，示威者游行到首都喀土穆的军事总部，并在那里停留了几天。安全部队试图强行驱散人群，但遭到一些军方人士的抵制，他们采取行动保护示威者;他们的行动表明，巴希尔不能再认为他得到了该国各种安全和军事力量的坚定支持。2019年4月11日，巴希尔在军事政变中被推翻并被逮捕。