在20世纪90年代，芝加哥公牛队建立了国家篮球协会(NBA)历史上最具统治力的王朝之一。由超级得分后卫带领迈克尔乔丹在这十年间(1991 - 93,1996 - 98)，这支球队赢得了六次NBA总冠军。
1966年，该连锁店在芝加哥成立。在鲍勃·勒夫、切特·沃克、杰里·斯隆和诺姆·范·里尔的带领下，公牛在1969-70赛季和1974-75赛季之间每年都能进入季后赛，但他们只有两次突破了首轮。在天才四人组离开球队后，公牛队陷入了平庸，在20世纪70年代末和80年代初的大部分时间里，公牛队都在输球。1984年，芝加哥在NBA选秀大会的第三顺位选中了乔丹，这支球队开始崛起。乔丹在1984-85赛季获得了NBA年度最佳新秀奖，并带领芝加哥公牛队连续14次进入附加赛。尽管乔丹个人表现出色，但在他执教的前三年里，公牛每年都在季后赛第一轮输掉了比赛。
1987年，芝加哥引进了前锋斯科蒂·皮蓬，他补充了乔丹的技术，极大地提高了这支年轻的球队。1989年，公牛队进入东部决赛，但连续第二年在附加赛中被公牛队淘汰底特律活塞队．赛季结束后，公牛队将主教练道格·柯林斯替换为菲尔-杰克逊．在杰克逊的带领下，乔丹、皮彭和一大批关键球员——包括前锋霍勒斯·格兰特、中锋比尔·卡特赖特和三分专家约翰·帕克森——将活塞队推进到第七场比赛，最终在1990年东部决赛中落败。第二年，公牛队终于战胜了他们的宿敌，横扫底特律队，在1991年的NBA总决赛中赢得了一个席位洛杉矶湖人队为了他们的第一个头衔。公牛队在1992年和1993年蝉联冠军，成为自2000年以来第一支获得三连冠的NBA球队波士顿凯尔特人队1959年到1966年，连续八次获得冠军。
乔丹在1993-94赛季前退役，理由是想继续职业棒球生涯。由于他的缺席，公牛队在1994年季后赛第二轮失利。1995年3月，乔丹重返球队，但他后来加入公牛队的名单并不足以阻止球队再次提前退出季后赛。在那个赛季之后，球队又增加了一个浮夸而又有争议的明星篮板手丹尼斯-罗德曼第二年，重获活力的公牛队创造了72胜10负的NBA纪录(2015-16赛季被公牛队打破)金州勇士)．公牛队以击败公牛队结束了他们的比赛西雅图超音速队1996年NBA总决赛。芝加哥公牛队在1997年和1998年再次进入总决赛，公牛队击败了公牛队犹他爵士队每次都能获得NBA总冠军。
在带领球队在八年内获得六次总冠军后，杰克逊对球队的管理，尤其是总经理杰里·克劳斯感到不满，在1997-98赛季后离开了芝加哥。他的离开促使乔丹第二次退役，皮蓬要求被交易，罗德曼决定与湖人签约。没有杰克逊和他们最好的三名球员，公牛队在接下来的四个赛季中以东部最差的战绩结束。缓慢的重建过程导致芝加哥从2004-05赛季开始连续三次进入附加赛。在明星控球后卫德里克·罗斯的发挥下，公牛队在2010-11赛季和2011-12赛季的常规赛中创造了NBA最佳战绩，但在前一个赛季，球队在东部决赛中失利，被8号种子击败费城76人队在第二场比赛中，罗斯因严重的膝盖受伤而缺阵。罗斯缺席了接下来的所有赛季，在2013-14赛季，他又因伤缺席了10场比赛，但顽强的公牛在两个赛季都没有巨星的情况下都成功晋级了附加赛。在2014-15赛季，罗斯出现在球队近三分之一的比赛中，公牛再次进入季后赛，但在第二轮输球。球队在2015-16赛季未能进入附加赛。
