皇家总督，耶稣会士和奴隶

王约翰三世决心通过统一低效部门来加强他在巴西的权威donatarios在中央管理之下。他被任命为总督Tomé德索萨他是一位葡萄牙贵族，在非洲有着丰富的经验印度．索萨于1549年登陆巴西并建立了萨尔瓦多巴伊亚(Bahia)，巴西曾在其首都统治了214年。索萨还安排地方官员管理船长，并加强沿海战略要地的防御。在城市中，他建立了类似于北方的市政组织葡萄牙．随后，巴西开始吸引越来越多的移民。到1600年巴伊亚而且伯南布哥每个殖民地都有大约2000名欧洲人，还有两倍多的非洲奴隶和印第安人。

耶稣会兄弟会提供的劳动力和专业知识对殖民地的发展至关重要。在约翰三世的要求下曼纽尔·达Nóbrega和其他几个耶稣会士陪同Tomé de Sousa到萨尔瓦多，成为第一个长长的传教士致力于保护和皈依印度人提高道德殖民者的等级。他们一使印第安人皈依基督教，耶稣会士就把他们安顿了下来aldeias(“村庄”)，类似于西班牙语中的传教美国．然而，大多数其他葡萄牙殖民者都拥有印第安奴隶，他们对耶稣会士控制如此宝贵的劳动力供应感到不满。两派之间产生了冲突，并在整个殖民地产生了反响，双方都向国王上诉。耶稣会士在1574年的一项皇家法令中取得了部分胜利，该法令授予他们对印第安人的完全控制权aldeias同时允许殖民者奴役在“合法战争”中俘获的印第安人。在亚马逊河盆地,父亲安东尼奥·维埃拉在17世纪成为了一场类似冲突的中心，当时他在那里建立了一系列传教活动。尽管这些任务帮助保护印度人免受奴隶制在美国，他们极大地促进了欧洲致命疾病的传播。巴西殖民者，面对一个复合16世纪中期劳动力短缺，进口了越来越多的非洲奴隶。

荷兰和法国的入侵

巴西还没有被置于葡萄牙皇家的统治之下法国决心在那里建立永久殖民地。1555年，法国军队占领了美丽的海港里约热内卢里约热内卢令人费解的是，葡萄牙人忽视了占领这片土地。一支庞大的葡萄牙军队Mem de Sá他封锁了港口的入口，最终迫使法国驻军投降，并在1567年建立了这座城市里约热内卢里约热内卢来抵御未来的袭击。

葡萄牙在1580年至1640年与西班牙联合，巴西因此受到西班牙敌人的攻击，包括新独立的巴西荷兰．1624年至1625年，荷兰人占领并短暂占领了萨尔瓦多荷兰西印度公司派遣了一支舰队占领了伯南布哥，在荷兰人的控制下持续了四分之一个世纪。公司选择了新领地的总督约翰·莫里斯，拿骚-锡根伯爵他是奥兰治家族的王子，也许是荷兰最能干的行政长官。荷兰人还邀请了杰出的艺术家和科学家向欧洲介绍巴西的资源和美丽;然而，公司的利润驱使的董事们拒绝支持约翰·莫里斯开明的他在1644年辞职。João费尔南德斯·维埃拉，一个富有的种植园主，随后发动了一场叛乱，稳步发展，反对约翰·莫里斯的无能继任者。1654年，在没有葡萄牙援助的情况下，巴西人击败并驱逐了荷兰人，这一成就激发了巴西人的民族主义情绪．

扩张与统一

巴西向西扩张是殖民时期最重要的事件之一。的《托尔德西拉斯条约》禁止葡萄牙人越过西经46°30 '，但巴西殖民者很快就扩展到远远超过这条线，分为三个群体:传教士，牧民和bandeirante(探险家和猎奴者)。传教士继续沿着亚马逊河，在南部和东南部扩展他们的触角。在东北部，寻找新牧场的养牛人从伯南布哥和巴伊亚的制糖区向内陆推进，直到现在的州Piaui，马拉尼昂,戈亚斯．圣保罗人，作为移民圣保罗他们在西进运动中最为活跃，组织了大规模的内陆远征，被称为bandeira为了捕获印第安奴隶和寻找黄金和珍贵的石头。其中一些更冒险bandeirante向西一直延伸到奥拓的银矿矿区秘鲁(现在的玻利维亚)和西北远至Bogotá哥伦比亚．在17世纪，他们探索了马托格罗索州并攻击reducciones(印第安人在西班牙控制地区的使命)在巴拉那河而且乌拉圭流域。印度人和耶稣会士抵制了大部分bandeirante侵犯，和附近Río德拉普拉塔当时，西班牙殖民者在现在的乌拉圭打败了入侵的圣保罗人。的bandeirante他的努力，虽然经常是暴力和残酷的，但对巴西这个巨大的次大陆的统一做出了重大贡献。

共同的文化特征和经济因素也有帮助集成该地区。的葡萄牙语在种植园居民、牧牛人、矿工、奴隶(包括印第安人和非洲人)、猎奴者和城市居民之间形成了一种共同的纽带，并将他们与其他地方说西班牙语的同伴区分开来南美．巴西人几乎都是从葡萄牙继承来的一个扩大的宗法家庭结构，少数几个强大家族的首领控制了几乎所有的土地、奴隶、牲畜，后来还控制了为殖民地创造财富的矿山。在殖民时期，巴西只有四个重要城市得到发展:萨尔瓦多、里约热内卢、累西腓,Ouro Preto．此外，葡萄牙与巴西各地保持着联系——尽管是间歇性的——巴西与邻近的西班牙殖民地之间几乎没有贸易或其他定期联系。这些共同的因素使巴西团结在一起尽管有很强的地区差异。