叶

维管植物的孢子囊严格来说是无性的，但是在种子植物，因为配子体完全依赖于孢子体和雌性配子体甚至在大孢子囊内，有性术语继续被错误地扩展到孢子体和带有孢子囊的器官。在所有针叶树的器官中含有microsporangia(“男性”)与患有大孢子囊症(“女性”)的患者是分开的Cephalotaxus，一些杜松(Juniperus)，以及家人紫杉科它们存在于不同的个体身上。

所有针叶树的小孢子囊都附着在单鳞片上花粉锥或小球果。花粉球果通常由薄的羊皮纸状鳞片(小孢子叶)组成，每个鳞片下表面带有两个或多个小孢子囊。鳞片的数量和大小变化很大，一些小球果的总长度约为2毫米(0.08英寸)柏树（Cupressus)种，有的超过20厘米(8英寸)南洋杉物种。

女性的差异很大(megasporangiate)针叶树的生殖结构是其生长发育的主要基础分类．大多数现存的针叶树都有一个被解释为复合球果;每个花苞鳞片插在苞片的腋部，相当于一个完整的单花粉球果。化石证据表明，祖先针叶树的每一个带胚珠的矮枝是如何缩小并融合成一个单一的圆锥鳞片的。像叶子一样，苞片和鳞片在轴上呈螺旋状排列，或成对或三对出现，现代针叶树的每个苞片和鳞片之间至少有一些融合。苞片和鳞片，或者结合鳞片的质地从木质到革质不等，在鸟类分散的刺柏中甚至有肉质(Juniperus)和家庭罗汉松科．不同针叶树的球果鳞片的数量和大小差异很大，导致球果的长度从3毫米(0.1英寸)到小于1克(0.04盎司)微生物群俄罗斯阿穆尔河地区的一种糖，长度超过40厘米(16英寸)松（松果体lambertiana)，一些南洋杉科植物的重量超过2.2公斤(4.9磅)，以及coulter pine (松果体coulteri)。

的大孢子球果Cephalotaxus大部分的Podocarpaceae与其他针叶树的球果具有相同的基本结构，但它们的种子非常小，主要由它们的大得多的种子组成，所以它们看起来不像球果。在红豆杉科中，即使是更大的修饰也完全消除了任何球果组织的痕迹，并且孤立的种子位于一个短分枝的尖端假种皮这是一种柄的杯状突起。

区分分类特征

现存的针叶树与其他裸子植物的不同之处在于单生花粉球果与复合球果(或红豆杉科单生终末种子)结合。虽然不是所有物种都拥有针叶，但只有针叶(形状各异)和带囊的花粉。其他一些功能，虽然不是独家对于针叶树来说，它们也比其他裸子植物更常见。这些包括扁平的、有翅的种子(也在植物中)千岁兰)，鳞片状的叶叶(也在麻黄属植物)，以及正常的生长习惯树或灌木(还在银杏）.