真菌生长在各种各样的全球环境。大多数真菌是陆地和被发现在所有温带和热带地区。一些物种生活在北极和南极地区,通常的一部分地衣。土壤富含有机质的理想栖息地的许多物种,只有少量的真菌在干旱地区或与很少或没有栖息地有机物。有些真菌寄生虫植物或动物,生活在宿主内至少在其生命周期的一部分。水生真菌通常居住在干净、凉爽的淡水,尽管一些物种中发现略微咸水,和一些在高度污染的溪流。
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