排泄器官
的肾脏大部分脊椎动物由大量的小管组成，这些小管是从叫做nephrotomes．在一些原始脊椎动物如圆口动物中，每个节段的肾质组只产生一个小管，但在绝大多数脊椎动物中，间质来自于相邻肾组融合成一个普通的肿块区别分成若干个肾小管，与原肾小管无关分割的中胚层．在原始条件下，每个小管通过漏斗(肾口)进入体腔;肾小管的两端融合形成肾集管。毛细血管的集合肾小球)与肾小管相连，形成肾小管的过滤装置。肾小球可能位于肾孔对面的体腔内，或者在所有更高级的动物中，插入肾小管，与肾小管形成肾小体肾脏。在两栖类以上所有脊椎动物的成体中，肾口消失(或从未形成)，因此肾小管从肾小体开始。脊椎动物肾脏的部分可被区分为肾前肾(最前面，在前肢水平)，这个中肾(在树干中部)，和后肾(在骨盆区域)。肾脏的三个部分在不同的阶段发育，开始于前肾，结束于后肾。在他们的形态和模式发展，前部比后部表现出更原始的状态。早期发育的原肾胚胎形成时，是鱼类和两栖类幼体的功能性肾脏。它的收集管开到肠的最后面，称为泄殖腔，后来也作为中肾的收集管。在爬行动物、鸟类和哺乳动物尽管在这些动物中，原肾管仍然作为中肾管存在，但它是无功能的。中肾发育较晚，取代原肾成为功能性肾脏成人鱼类和两栖动物还有爬行动物、鸟类和哺乳动物的胚胎。中肾小管与原肾导管相连。肾前管实际上刺激中肾小管的发育，如果没有肾前管，中肾根本不发育。
后肾只存在于爬行动物、鸟类和哺乳动物中。它取代了早期胚胎阶段的中肾，并在这些动物的胚胎后和成年生活中继续作为功能肾脏。后肾由来自躯干后部肾组的间充质发育而来，位于中肾管的背侧。实际分化是由中肾管的背侧生长开始的，称为中肾管输尿管的萌芽状态。输尿管芽沿间质方向生长，形成输尿管芽输尿管．穿透间质后，开始分叉，形成肾脏的集肾小管;与此同时，间质对导管及其分支的影响作出反应，聚合肾小管形成肾的排泄小管输尿管的影响对于后肾排泄小管的发育是不可缺少的，因为如果输尿管不能发育，或者在其生长过程中不能到达产生肾脏的间质，则没有肾脏发育。
循环器官
的雏形心在脊椎动物中，从身体前部的中胚层膜的腹侧边缘发育，紧挨着咽部。一组中胚层细胞从侧板的腹侧边缘分离出来，位于咽部的正下方内胚层，并以薄壁管的形式排列，该薄壁管将成为心内膜或心脏内膜。在脊椎动物中具有完全的分裂，心内膜管从一开始就是单一的内侧。在具有成母细胞卵裂的高等脊椎动物——爬行动物、鸟类和哺乳动物——发育早期的胚胎在卵黄囊表面是扁平的;因此，在形态学上，什么是中胚层的腹侧边缘地幔在胚盘周围离得很远。由于这种排列，形成了两个心内膜管，一个在胚胎的两侧。随后，当胚胎与卵黄囊分离时，两个心内膜管在咽腹侧的中线相遇并融合，产生一个单一的心脏雏形。心内膜或心脏内膜形成后，毗邻心脏底质的侧板中胚层体腔轻微扩张并包裹心内膜管。心肌层，或者心肌，是从发自肺腑的(内脏)与心内膜管接触的侧板层;侧板的壁层(体层)形成心包，或心脏的覆盖。围绕心脏的部分体腔与体腔的其余部分分离，并发育成心包腔。
心内膜管向前分支为两根管，即腹侧管主动脉;心内膜管的一个类似分支在后面形成了两条卵黄静脉，它们将血液从中肠内胚层或蛋黄囊(当存在时)输送到心脏。
心脏雏形在其最早的发育阶段，对毗邻的内胚层有一定程度的依赖。在神经管期的蝾螈胚胎中，整个内胚层可以被切除。在这种无内胚层的胚胎中，心脏无法发育，尽管还留有注定形成心脏雏形的中胚层完整的．
心脏最初是一根向前后方向伸展的直管。然而，在发育的早期，它会以一种特有的方式扭曲，并细分为四个主要部分:最后面的部分、前额叶和前额叶静脉窦;的中庭，位于管的前向弯曲处;的心室，占据后腹向屈折的顶点;最前面是动脉圆锥。在更高级的脊椎动物的发育过程中，心房和心室部分或完全细分为左右两半。在两栖动物中，只有心房被a分隔成两半分区从尾部开始。在爬行动物中，有一个隔板将心房和部分心室隔开。在鸟类和哺乳动物中，心脏的细分是完整的，有两个心房和两个心室。
心脏的完全细分对于分离心脏是很重要的肺或肺，血液供应来自全身循环。但是，如果这种分离在胚胎早期就发生了，就会产生困难，因为胚胎的肺没有功能;相反，血液中氧气的富集发生在血液中胎盘．在哺乳动物胚胎中，心房之间的分隔仍然不完整，因此从身体和胎盘返回的血液进入心脏的右半边分流的(通过心房间孔)进入心脏的左半边，再从那里进入全身循环。在出生然而，心房间孔被膜瓣封闭，体内缺氧的血液进入右心房，进入右心室，再从右心室进入肺供氧。
在成年脊椎动物中，血管延伸到身体的各个部位。血液供应的通道似乎与组织的局部需求成比例;逐渐发育的器官或功能特别强化的部分总是得到更多的血液供应。血管的雏形总是间充质细胞的聚集。在任何血管首先形成内皮管，然后加入肌肉层和弹性层。
脊椎动物的主要血液通道在某些有利条件下发育;即(1)内胚层与横向板中胚层;(2)肾周围，尤其是原肾和中肾;(3)与心脏有关，这是第一类的特殊情况。
从心脏的成对向前延伸，腹主动脉，在咽裂之间形成环路。这些是主动脉弓，水生脊椎动物最初用于向鳃供血的动脉弓所有脊椎动物都有足弓，在圆口动物和鱼类中发现有六个或更多足弓;四足动物的胚胎中有六种，但前两种是退化的。第三对的弓发育为颈动脉，为头部供血。第四对(在泌尿道中，第五对也是例外)与背侧相连形成背主动脉，为身体的大部分提供血液。这些是系统性拱门。第六对的弓是肺弓;在胚胎中，它们将血液输送到背主动脉以及肺部，但在完全发育的羊膜动物(爬行动物、鸟类和哺乳动物)中，它们只将血液输送到肺部。
早期胚胎心脏的成对的后部延伸是卵黄脉，其分支在侧板中胚层和内胚层之间展开，尤指蛋黄囊的内胚层。在到达心脏的过程中，卵黄静脉穿过肝脏，分裂成一个小通道系统——肝窦。部分卵黄静脉横卧后到达肝脏的是肝门静脉，它将血液从肠道运送到肝脏;在低等脊椎动物(羊膜动物)，卵黄静脉在肝脏前面的部分成为肝静脉，将血液从肝脏输送到静脉窦，而在羊膜动物中则成为腔静脉后静脉的前部。
而卵黄静脉和后来的肝静脉门静脉从胚胎的内胚层和卵黄囊输送血液到心脏，从中胚层和外胚层的血液通过一个系统回流到心脏红衣主教静脉．后一种静脉以不规则窦的形式开始发育，围绕着肾原体，由两侧的共同主静脉(居维叶导管)连接到静脉窦。前面和后面的延伸分别产生前枢机脉和后枢机脉。的postcaval静脉，存在于陆生脊椎动物中，在进化和胚胎发生中都是一种后期习得;这是包括卵黄静脉前部在内的几个静脉通道相互作用的结果。
第一个血脊椎动物胚胎细胞的形成与卵黄囊上的肠内胚层有关。来自侧板的内脏层的中胚层细胞群(存在卵黄囊的情况下是胚胎外的)成为所谓的血岛引人注目的在鸟类胚胎的卵黄囊上(在脉管区)。在鸟蛋中，血岛的内部细胞早在孵化的第二天就开始产生血红蛋白(血液的气体携带成分)，并成为第一批红细胞(红细胞)。血岛的外层细胞发育为内皮层，并形成覆盖部分卵黄囊表面的血管网络。网络获得与卵黄静脉和卵黄动脉的连接(后者是背主动脉的分支);因此血岛中形成的血球可以进入一般的血液循环。
在胚胎发生的后期，血细胞的形成从血岛转移到肝脏，再后来，转移到骨髓．