珊瑚礁地球化学
在溶液中存在微量的金属元素海水也发生在海军陆战队无脊椎动物骨骼，尽管比例和周围的水不一样。镁而且锶是最常发生的吗微量元素在珊瑚礁骨架中，以千分之一来测量，但是钡，锰,铁也存在，可以用百万分之一来测量。在太平洋珊瑚中，2.17 ppm铀已被发现，在佛罗里达珊瑚2.36-2.95 ppm。锶集中在文石骨架中，镁集中在钙石骨架中。珊瑚霰石锶含量高于(某些)软体动物文石。镁的含量方解石的珊瑚藻类是高的，而藤壶炮弹含量低(11.5‰)。通过识别这些微量元素及其在不同生物体内的同化程度，沉积物以珊瑚骨架为主碎屑可与主要来自软体动物或珊瑚藻类的沉积物区别开来。
原子吸收分光光度法在水螅珊瑚的文石骨架中有超微量的金属Millepora来自暗礁平在珊瑚海高原附近昆士兰．以十亿分之一计算:引领(100),铜(71),镉(23),钴(17),镍(1480)，铁(507)锌(507)。
珊瑚礁地球化学的另一个方面是碳氧同位素作文珊瑚的骨架和贝壳。碳数的测定同位素Present提供了一种评估样品年龄的方法，氧同位素的测定在指示珊瑚礁生长期间发生的水温变化方面是有用的。
风、水流、温度和盐度
风和洋流在形成单个礁石和确定礁石的方向、形状和位置方面很重要珊瑚沙子沙洲或“低岛”，是在珊瑚礁上发展起来的。海流主要是由盛行风产生的，但是，在潮差很大的地区，潮汐效应可能会产生派拉蒙．
岩礁可能是圆形，椭圆形(或船形)，或不规则的轮廓。当沉积物从珊瑚礁表面被抬升并被带到下风时，它们就产生了波或者是潮汐流，然后沉积在水流速度突然降低的地方。因此，它们通常形成在珊瑚礁较受保护的背风端。低空风作用潮这些存款可能会增加沙丘在高水位线以上。海滩岩可能由碳酸盐形成胶结在潮位之间的沉积物中的谷物。然后它就起到了稳定因素的作用。暴风雨可能会把珊瑚碎片推向前方派生的由鹿角珊瑚生长在礁的迎风斜坡上，形成瓦银行;这样就可以形成连续的叠岸。河岸上的瓦片可能会被加固，从而增加了相当大的稳定性礁，就像植物的生长一样。飓风然而，即使是稳定的珊瑚礁，也可能会侵蚀它们的海岸线。巨大的、孤立的珊瑚或珊瑚石石灰石在珊瑚礁边缘很常见。有些可能是曾经出现的珊瑚礁平台的残余;还有飓风或风暴杂物。
珊瑚礁在年平均地表水温度约23-25°C(73-77°F)的地方最发达。当温度低于18°C(约64°F)时，没有显著的珊瑚礁出现，尽管有一些珊瑚礁珊瑚物种可以在比这低得多的温度下生存。任何一个珊瑚礁上的季节温差通常都很小，因为水的深度或珊瑚礁上的情况不同。
正常海洋海水盐度(百万分之30至40之间)，这是珊瑚所受限制的范围碳酸钙(CaCO3.)，使足够的钙离子(Ca2 +)可用于骨骼形成过程。淡水泛滥可能会摧毁近岸生物岸珊瑚礁。皇后区鲍文附近石岛上一个繁茂的暗礁。, Austrl。，was killed to a depth of 3 metres (about 10 feet) below mean tide level by a week of cyclonic rains during which 90.7 cm (about 36 inches) of rain coincided with full-moon spring tides.
生物因素
礁堆积最重要的生物决定因素是黄藻在所有礁珊瑚、许多大壳软体动物(三甲科)和其他有壳无脊椎动物的活组织中，以及在软体水螅、泥虫和珊瑚虫的活组织中。虫黄藻现在被认为代表了甲藻的营养阶段，它们与珊瑚礁珊瑚的关系是共生即:，mutually helpful. In温带它们只是偶尔发生。它们在珊瑚礁动物中的大量存在无疑与更大的光强度而且辐射能因为，像其他植物原生生物一样，虫黄藻需要阳光光合作用．它们从源头部分移除二氧化碳，连同氮，磷,硫，由珊瑚体内的新陈代谢分解而产生，否则会被珊瑚排出体外。它们通过加快珊瑚代谢过程中产生的二氧化碳被清除的速度和骨骼碳酸钙形成的速度，极大地帮助了珊瑚骨骼的形成。珊瑚也可以从黄藻中获得一些营养，但它们可能不需要光合作用过程中产生的氧气。
珊瑚礁的生物生产力是一个重要的研究领域。以…的形式不断地提供食物浮游动物对食肉的礁珊瑚来说是必不可少的。浮游动物的供给依赖于充足的水源浮游植物供给，而浮游植物反过来也需要充足的供给植物营养物溶解在水中。一个环礁在户外海洋可以比作绿洲在一个沙漠作为当地的高生产力中心。在温暖，明亮，混合的地方环礁湖水域有一个快速的周转流行浮游生物(漂浮或游泳)和底栖生物(住在海底)人口每年大概12.5次。碳酸盐骨架物质在环礁顶部的积累速度可能比在环礁周围的深处快1000倍。