脓肿

肛周区域脓肿(由分解组织形成的脓液腔)是许多疾病和障碍的常见复杂特征大肠．真菌感染的潮湿，有时不清洁的区域周围肛门是常见的，并允许浸渍(或逐渐分解)组织和入侵的细菌从皮肤和结肠。糖尿病患者易受皮肤感染，肛周卫生非常重要。

细菌感染

结肠可能因为致病细菌或寄生虫的入侵而发炎。的各种种类志贺氏杆菌，例如，攻击粘膜并产生严重但浅表的出血。在婴儿和老年人中，由于强烈的炎症反应而损失的液体和蛋白质的量可能是致命的，但通常在其他方面健康的人这种症状不那么严重。沙门氏菌种，负责严重的广泛性感染源于入侵小肠，会损害结肠的淋巴滤泡，但不会引起全身性的结肠炎症(结肠炎)．另一方面，巨细胞病毒可引起严重的结肠炎，产生溃疡。Lymphopathia venereum引起更广泛和浅表的结肠炎。

食物残渣提供了极好的培养基对于细菌来说，结肠内部是一个近乎理想的地方环境为了他们的成长。在结肠中产生疾病的分布最广泛的寄生虫是原生动物痢疾阿米巴．这种寄生虫进入消化道通过口并住在盲肠和升号。这通常会导致升结肠过敏和不能正确吸收水分，因此断断续续的,水腹泻随之而来。阿米巴原虫破坏粘膜层，并可能造成大量出血的大溃疡。粪便含有血液，但几乎没有脓汁或结肠对入侵生物的其他反应证据。在更广泛的阿米巴结肠炎中直肠而且乙状结肠被大肠阿米巴,这清单它们的存在是由一个相对正常的粘膜隔开的许多离散的溃疡。阿米巴原虫可进入门静脉循环并被携带至肝在这种情况下，脓肿会形成，有时会破裂到胸部或胸部腹腔．血液免疫测试可能会有帮助诊断．在从溃疡边缘或粪便中直接涂片检测出寄生虫后，将阿米巴药物和广谱抗生素联合使用。一种对多种寄生虫都有毒性的抗生素，通常是甲硝唑和四环素。

结肠炎

在西方国家，慢性结肠炎(结肠炎症)最常见的形式，溃疡性结肠炎，是特发性的(即原因不明)。溃疡性结肠炎由胃粘膜的轻度炎症演变而来直肠，导致过多的粘液和一些血在粪便中，严重的，突然的疾病，破坏大部分结肠粘膜，大量失血，毒血症，和不常见的穿孔。最常见的类型仅影响直肠和乙状结肠特征通过腹泻还有粘液的通过。溃疡性结肠炎往往遵循缓解-复发的过程。通过结肠镜检查或活组织检查来确定诊断。

另一种类型的结肠炎是由于使用抗生素导致结肠中某些类型的细菌异常增殖，从而导致炎症。这种疾病的治疗方法是停止使用抗生素，并使用其他抗生素，如万古霉素或墨罗硝唑。大约15%的结肠炎病例涉及疾病扩展到最初受影响的区域以外，并且严重程度增加。在广泛破坏的情况下，在治疗后10至20年存在恶性肿瘤的风险发病这种疾病。