的眼睛
为了眼睛为了正常工作，特定的自主功能必须保持四种类型的调节平滑肌:(1）平滑肌的虹膜，它控制着通过玻璃的光量学生到视网膜, (2)睫状肌在眼睛的内部，它控制着对附近物体的聚焦能力，(3)动脉平滑肌为眼睛提供氧气，(4)静脉平滑肌从眼睛排出血液并影响眼压。此外，角膜必须靠泪腺的分泌物保持湿润。
当强光照进眼睛时，两只眼睛的瞳孔都会收缩。这个响应称为光反射，由三种结构调节视网膜，前盖，和中脑．视网膜上有三个神经元电路由感光细胞组成(棒)、双极细胞和视网膜神经节细胞。后者将光度信息传递给pretectum，其中特定类型的神经元将信息传递给副交感神经节前神经元Edinger-Westphal核中脑。这些神经元的轴突由中脑的腹侧表面和睫状节的突触发出。从那里，副交感神经节后神经元支配瞳孔括约肌，导致收缩。
为了使附近的物体成为焦点，眼睛的外部和内部肌肉都必须发生一些变化。最初的刺激住宿是一个模糊的视觉图像，首先到达视觉皮层。通过一系列皮层连接，模糊的图像到达两个专门的运动中心。其中一个位于额叶皮层，向控制内侧直肌的动眼肌核中的神经元发送运动指令;这导致眼睛收敛．另一个运动中心位于颞叶，起调节作用。通过多神经通路，它激活由睫状节产生的特定副交感神经通路。这条通路导致睫状肌收缩，从而减少晶状体上的张力，使其变得更圆，这样近物体的图像就可以聚焦在视网膜的中央部分。同时，虹膜也受眼球运动副交感神经系统的控制，进一步收缩增强镜头的分辨率。
的泌尿系统
的功能尿膀胱完全取决于自主神经系统．例如,尿液通过激活起源于脊髓节段侧角的交感神经通路而保留11- l2；这些导致平滑肌收缩形成内尿括约肌．的外尿括约肌它与内部括约肌协同工作，是由骨骼肌由阴部神经的运动纤维控制。这些纤维，产生于节段S的腹角2- s4，提供外括约肌的强直性兴奋。因为他们是自愿控制的，排尿是由高级大脑中心发起的。自愿的抑制骶骨运动流出导致外尿括约肌松弛。与此同时，腹壁肌肉收缩引起的腹部压力增加，开始了尿液的流动。随后是交感神经流出的反射性抑制，导致内尿括约肌松弛，并通过激活通往平滑肌的副交感神经流出，导致膀胱收缩并排出尿液。
而自主神经系统对大脑的功能并不是至关重要的肾脏例如，水的维持、电解质的平衡和血管活性激素的产生等过程的微调肾素红细胞生成素是由交感神经纤维调节的。