系统性红斑狼疮

系统性红斑狼疮(SLE)是一种以器官损害为特征的综合征沉积免疫复合物。当产生对抗核酸和蛋白质的自身抗体时，免疫复合物就形成了成分细胞核的。这种自身抗体，称为抗核抗体这种病毒不会攻击健康细胞，因为细胞核在细胞内，抗体无法接近。抗原抗体复合体只有在细胞死亡的正常过程中，细胞的核内容物被释放到血液中时才会形成炎症．由此产生的免疫复合物沉积在组织中，造成损伤。某些器官比其他器官更容易受累，包括肾脏、关节、皮肤、心脏和肺周围的浆膜。

多发性硬化症

多发性硬化症是一个自身免疫性疾病这导致围绕神经纤维的髓鞘逐渐被破坏。它的特点是神经功能的进行性退化，并伴有明显的缓解期。的脑脊髓液多发性硬化症患者体内含有大量针对髓鞘基本蛋白和其他脑蛋白的抗体。浸润的淋巴细胞和巨噬细胞可能加剧破坏性反应。原因是免疫系统对髓鞘发起攻击尚不清楚，但几种病毒被认为是反应的启动者。这种疾病的遗传倾向已被注意到;对这种疾病的易感性是由主要组织相容性复合体(MHC)基因，产生B细胞和一些T细胞表面的蛋白质。

I型(胰岛素依赖型)糖尿病

I型糖尿病是糖尿病的自身免疫形式，常发生于儿童时期。它是由胰腺组织细胞的破坏引起的朗格汉斯岛．这些细胞通常会产生胰岛素这是一种帮助调节的激素葡萄糖血液中的水平。I型糖尿病患者由于缺乏胰岛素而导致高血糖水平。功能障碍胰岛细胞的增殖是由细胞毒性T细胞或自身抗体的产生引起的。虽然这种自身免疫反应的起始原因尚不清楚，但这种疾病的遗传倾向也涉及II类MHC基因。可以通过注射胰岛素来治疗;然而，即使经过治疗，I型糖尿病最终也可能导致肾功能衰竭失明或严重的四肢循环困难。

其他自身免疫性疾病

与产生自身免疫性溶血性贫血的机制类似，可导致形成针对粒细胞和血小板的抗体，尽管针对这些血细胞的自身免疫攻击发生的频率较低。针对其他类型细胞的抗体出现在一些自身免疫性疾病中，这些自我反应性反应可能是造成损害的主要原因发生．在重症肌无力这是一种以肌肉无力为特征的疾病，其自身抗体会对肌肉细胞上的受体产生反应。通常情况下，受体与乙酰胆碱是一种神经末梢释放的神经递质。当乙酰胆碱与肌肉细胞表面的乙酰胆碱受体结合时，它会刺激肌肉收缩。重症肌无力的自身抗体与乙酰胆碱受体结合而不激活它们。抗体通过阻断乙酰胆碱与其受体的结合或完全破坏受体来防止肌肉收缩。这使得肌肉对乙酰胆碱的反应减弱，最终削弱肌肉收缩。

提供了一个不同的例子Goodpasture综合症这是一种针对血液基底膜形成自身抗体的疾病船只在肾小球和肺的气囊中。自身抗体会导致严重的肾损伤和肺出血。