自林奈以来的分类

分类因为林奈整合了新发现的信息，更接近自然系统。当生命的历史藤壶被发现了，例如，他们不能再与软体动物因为很明显他们是节肢动物(有关节腿的动物，如螃蟹和昆虫)。让-巴蒂斯特·拉马克他是一位优秀的分类学家，尽管他对进化，先分离蜘蛛而且甲壳类动物从昆虫中分离出来。他还介绍了不再被所有工人视为完全有效的区分脊椎动物即:，有脊椎的动物，比如鱼，两栖动物爬行动物、鸟类、哺乳动物以及没有脊椎的无脊椎动物。的无脊椎动物，是由它们缺乏的特征而不是它们拥有的特征来定义的，构成事实上，大约90%的多样性在所有动物中。“Infusoria”这个混合组，包括干草放在水中会出现的所有微观形态，被这位法国生物学家根据经验划分为几个组Felix雅．德国生物学家Ernst Haeckel提出了这个术语原生生物在1866年，他主要将单细胞植物和动物包括在内，因为他意识到，在单细胞水平上，植物和动物之间不再有明显的区别。

澄清关系的过程仍在继续。直到1898年才发现致病因子(病毒)，并通过最好的过滤器，直到1935年，第一个完全净化病毒获得了。原始的孢子产陆生植物(裸叶植物属)寒武纪它于1859年在加拿大被发现，距今约5.41亿至4.85亿年前。德国植物学家威廉他在1851年给出了第一个很好的描述世代交替在各种不开花的(隐花的)植物中，高等植物的许多主要分支都以其为基础。毛竹门(beardworms)直到20世纪才得到承认。

直接影响达尔文式的进化上分类对许多生物群体来说是微不足道的，对另一些则是不幸的。当分类学家开始接受进化论时，他们认识到曾经被描述为自然亲缘性的东西。例如，具有许多相同特征的形式或多或少的密切相似性，可以用进化的关系来解释血统．在小组中很少或没有化石记录，结果是解释的改变，而不是分类的改变。不幸的是，一些权威认为他们可以从某种进化原理中衍生出这个群体，将继续对它进行重新分类。例如，蚯蚓及其同族(寡毛纲)的分类在进化理论出现后被改变了。以前，人们研究蚯蚓时，采用的是最容易获得的最复杂的生物，然后在其下面逐步排列简单的形态。最简单的寡毛动物，微小的淡水蠕虫Aeolosoma，被认为是最原始的，分类器在它上面逐步排列复杂的形式。后来，当人们意识到Aeolosoma很可能是二次简化(即从更复杂的形式进化而来)，倾向于从系列的中间开始，向两个方向工作。有偏见的主要亚群的名称(Archioligochaeta, Neoligochaeta)被广泛接受，但实际上并没有证据表明这一亚群和其他亚群的进化过程动物组。好的群体化石记录少遭受这种类型的重新分类，因为好化石材料允许根据自然亲和力放置形式;了解地层在这篇论文中，他们被发现可以形成a种系发生树(即基于进化关系的图)，或枝状图(亦称树状图)，不论其理论为何(另请参阅种系发生）.

达尔文进化论的长期影响是不同的，也是非常重要的。它表明，如果有足够的信息，生物的基本排列将是一个系统发育树，而不是一组离散的类。然而，许多类群所知甚少，以至于将生物体排列成树突是不可能的。广泛而详细的化石序列——实际标本的布局——必须被任意分解。许多团体，特别是在物种水平上，显示出很大的地理差异，以至于简单地定义物种是不可能的。在种的层次上进行分类是相当困难的。许多植物表现出网状(链式)进化，在这种进化中，物种形成，然后杂交，导致新物种的形成。又因为许多植物和动物都放弃了性繁殖，一如往常标准因为物种——在一群个体间的杂交——是不适用的。没有关于病毒此外，似乎与高等生物的物种相对应。