中世纪的怀疑
绝对怀疑主义作为罗马帝国晚期的一场哲学运动而结束，因为宗教问题变得至关重要。在基督教中世纪的主要现存形式怀疑是学院派，如在圣奥古斯汀反academicos．奥古斯丁在从异教皈依基督教之前，就发现西塞罗的观点很有吸引力。但是克服了这些困难启示，他描述了他后来的经历哲学作为信仰寻求理解。奥古斯丁对怀疑主义的描述和他对它的回答提供了基础中世纪的讨论。
在伊斯兰教在西班牙，穆斯林和犹太神学家之间产生了一种反理性的怀疑主义。Al-Ghazā李他是11世纪和12世纪早期的阿拉伯神学家，与他同时代的犹太人犹大ha-Levi他是一位诗人、医生和哲学家，他对同时代的亚里士多德学派提出了怀疑的挑战，以引导人们在神秘信仰的基础上接受宗教真理。观点是真理宗教最终是建立在信仰而不是推理或证据的基础上的信仰主义中世纪晚期的德国红衣主教、库萨的哲学家尼古拉斯(Nicolaus of Cusa)采用了这一方法，他提倡学习无知作为通往宗教知识的途径。另一种包含怀疑元素的思路是奥卡姆的威廉(1285-1347)，他探索了历史的逻辑结果信仰上帝是一切知识的起源。他们研究了上帝是否可以不顾证据而欺骗人类，以及他是否可以让人类的所有推理都开放怀疑．
现代的怀疑
现代怀疑论部分源自奥卡姆的中世纪观点，但其主要来源是对怀疑论经典的重新发现。皮罗人的传统在中世纪鲜为人知，但在15世纪的文本塞克斯都·恩披里克在希腊语中是从拜占庭帝国到意大利。(塞克斯都的拉丁文译本皮龙主义的概要而且反对教条主义者分别于1562年和1569年出版，两者的希腊文本均于1621年出版。)对西塞罗的兴趣也是恢复，和他的Academica而且De natura deorum也出版于16世纪。
探险:探险的航行;人文主义的再发现的学习古希腊罗马和巴勒斯坦;以及“新科学”——所有这些结合在一起，削弱了人们对被广泛接受的世界宗教图景的信心。后来，在改革而且反对改革之间的教义争议新教徒而且罗马天主教徒提出了基本的认识论问题的基础和标准宗教知识。
的改革
在15世纪，学者们在佛罗伦萨圣马可修道院，那里的基督教改革家萨沃纳罗拉Girolamo是一名讲师，在那里保存的一些手稿中研究了塞克斯图斯的观点。萨伏那罗拉敦促他的两个修道士把塞克斯都翻译成拉丁文，以此来显示所有异教哲学的虚荣心。然而，在他们完成这项任务之前，萨伏那罗拉被作为异教徒审判并处决。其中一个门徒Gianfrancesco pico，意大利柏拉图主义者的侄子Pico della Mirandola发表反省Vanitatis(1520)，第一部运用怀疑主义作为挑战整个哲学的手段的作品。这也是第一部为欧洲观众用拉丁语讨论塞克斯都的作品。
在16世纪的辩论中，怀疑论是核心伊拉斯谟而且马丁。路德．利用学术怀疑论的材料，伊拉斯谟坚持认为争议的问题无法解决，因此人们应该暂停判断，留在罗马天主教会中。另一方面，路德坚持认为，真正的、确定的宗教知识可以而且必须通过宗教来获得良心．伊拉斯谟的观点发展成为一种基督教怀疑主义，在信仰上接受了传统基督教。路德的观点，以及后来的卡尔文，提出了一种新的标准——内在经验。天主教徒反对改革与此同时，他利用皮龙主义和学术主义的论点试图破坏路德的观点标准．
伊拉斯谟的当代h·c·阿格里帕·冯·内茨海姆暴风雨神秘的哲学家和医生，用怀疑的观点来反对经院哲学,文艺复兴自然主义等许多观点，以赢得人们的关注罗马天主教“真正的宗教”。同样，天主教学者在他1569年翻译的《塞克斯都》的序言中，赫维认为怀疑论是对加尔文主义的最终答案，也是通往真正基督教的道路。
这种对怀疑主义的新关注在16世纪被赋予了一个一般的哲学提法蒙田还有他的堂兄旧金山Sanches．蒙田,为雷蒙德·塞邦德道歉桑切斯在qud nihil scitur(《为什么什么都不可知》)，这两本书都写于1576年，探讨了人类的认识论状况，并表明所有领域的知识主张都是极其可疑的。蒙田建议按照自然和习俗生活，接受上帝所揭示的一切，而桑切斯主张认识到没有什么是可以知道的，然后努力获得一个人可以通过的有限信息经验科学的含义。