看到研究模拟人类鼻病毒使用IBM的3 - d运动的蓝色基因问计算机理解病毒是如何工作的

艾拉凯利:澳大利亚墨尔本研究人员正在使用最快的超级计算机模拟,首次完整的3 d运动人类鼻病毒,感冒的主要原因。虽然对于大多数人来说,感冒可以用非处方药物,缓解鼻病毒可以导致住院甚至死亡在35%以上的急性慢性阻塞性肺疾病患者。

也与70%的哮喘发作可导致住院治疗。研究由迈克尔·帕克教授领导,来自墨尔本大学的Bio21研究所和圣文森特的研究所,导致创建第一个3 d模拟鼻病毒的运动,以及它如何绑定到一个新的生物群抗病毒药物。

迈克尔·帕克:我们已经能够使用超级计算机,蓝色基因,在墨尔本大学模拟病毒在三维空间的运动。第一个是什么是我们现在能做到与整个病毒,包括其在病毒遗传物质。这是一个世界第一。

迈克尔·柯伊伯:嗯,最让人兴奋的是有这些生物实体建模的能力为了了解病毒是如何工作的。我们要做的是整个病毒一块一块的模型。第一次,真的,我们已经能够这样做,因为我们有一个足够大的足够快的计算机能够做这个任务。

我们这里是我们的鼻病毒的模型。这里我们看到的是它的基本组件。当我们放大到病毒的病毒。病毒本身就像是一个鸡蛋。你有外面的一点或外壳,我们称之为衣壳。我们内部有RNA。RNA是传染性的部分。所以一旦我们的细胞内,这是什么使我们生病。

凯莉:研究小组正致力于新安装的IBM的“蓝色基因问墨尔本大学,与计算生物学家从IBM为生命科学研究合作实验室,墨尔本和VLSCI,维多利亚时代生命科学计算倡议。

约翰·瓦格纳:蓝色基因问大约是800次浮点运算。这是大致相当于大约20000桌面系统。所以蓝色基因实际上允许我们做更复杂和更大的计算在更短的时间。

电脑的使用在生物学并不新鲜。新鲜的是水平的细节和复杂的计算我们可以做。基本上允许我们做科学在21世纪以一种新的方式。

凯莉:希望本研究与新药开发的超级计算机将打开门,全世界挽救许多的生命。